در حساب ذخیره ارزی رئیس‌جمهور عضو هیات امنا نبود، در حالی که در صندوق توسعه ملی، وی رئیس هیات امناست. این به معنای آن است که در تدوین اساسنامه رئیس هیات عامل نیز رئیس جمهور بوده و رئیس کل صندوق نیز وزیر اقتصاد یا معاون برنامه‌ریزی ریاست جمهوری است. دولت در نظر دارد صنوق توسعه ملی را کاملا دولتی و در خارج از بانک مرکزی تشکیل دهد. مقایسه ساختار حساب ذخیره ارزی با صندوق توسعه ملی نشان می دهد دولت قصد دارد مدیریت کامل صندوق را خود برعهده گیرد. با توجه به بستر نابسامان آینده اش مشخص نیست.